L’histoire se déroule un peu avant et durant la révolution française ; Mathilde Pasquier (Simone Lorraine dans la version originale), une jeune vendeuse de fleurs, devient la nuit une justicière masquée au nom symbolique "d’Épée de la Liberté" (Étoile de la Seine en VO). Elle se bat sur son bel étalon blanc aux côtés de François de Vaudreuil (Robert de Forge en VO) dit la "Tulipe Noire", un jeune homme masqué lui aussi qui monte un joli cheval noir. Elle combat pour les habitants opprimés de Paris et les aide dans la lutte contre le despotisme des aristocrates qui s'affrontent pour le pouvoir. On apprendra que Mathilde est en fait la fille illégitime du roi d’Autriche, donc la demi-sœur de Marie-Antoinette qu’elle va aider à son tour.

Une jeune fille travaillant pour la télévision reçoit une cassette aux allures de snuff movie sur laquelle on voit une fille torturée et enfin assassinée. Elle décide de faire une enquête sur les lieux de tournage de cette vidéo mais, une fois sur place, les différents membres de l'équipe de tournage vont être décimés par un étrange tueur masqué...

Début 19ème siècle. De retour à Edo après trois ans d'études à Nagasaki, le jeune docteur Noboru Yasumoto est décidé à y faire une brillante carrière. Il rêve d'une nomination dans l'hôpital du Shogunat. Sa connaissance de la médecine occidentale et ses origines le destinent aux plus hautes sphères médicales. Mais sa première affectation l'envoie dans un quartier très pauvre de Tokyo, à la clinique de l'intransigeant Dr Niide dit "Barberousse". Egoïste et arriviste, le docteur est mécontent d'être aux ordres d'un médecin dans un endroit qui ne correspond pas à son diplôme et à son ambition. Mais peu à peu, Yasumoto surmonte son amère déception et s'attache aux malades et à son étrange patron. Barberousse est un médecin atypique au coeur pur entièrement dévoué à la cause des plus pauvres. En fréquentant les laissés pour compte de la société, Noboru s'humanise...